注册会计师总目标是指对被审计单位财政财务收支活动的真实性、正确性、合理性、合法性、合规性、公允性、有效性、一贯性进行评价和审查，我国《独立审计基本准则》规定，独立审计的总目标是对被审计单位会计报表的合法性和公允性发表审计意见。审计总目标的确定以审计环境为基础，并随审计环境的变化而变化。
根据审计环境变化，审计可以划分为详细审计、资产负债表审计和财务报表审计三个阶段，不同的审计发展阶段的审计总目标内涵也有所不同。尽管审计总目标发生了变化，但注册会计师审计的主要职责依然是对被审计单位财务报表进行审计。财务报表的合法性及其公允性始终是注册会计师审计的主要目标。
