注册会计师独立审计是注册会计师不受任何利害关系的影响，自始至终保持其客观性，保持其职业怀疑态度，在执行审计和审阅业务以及其他鉴证业务时，提出客观公允的结论。
独立审计即是审计的独立性，因审计工作涉及市场经济的利益公平，独立性被职业界视为审计的灵魂。一般而言，影响我国注册会计师独立审计的因素主要有：体制因素，某些地方政府为扶持本地会计师事务所发展会过多地进行行政干预，导致了会计师事务所之间的不公平竞争，形成行业垄断和地区垄断，会计师事务所出具的审计报告也无法摆脱行政的力量；缺乏严厉的事后惩罚机制；社会公众通过被审单位委托付费，在经济利益的驱使下，注册会计师可能会收取被审单位的审计费用，却不向支付费用的社会公众负责。
