抗体形成的一种理论。
认为抗体分子是在与抗原分子紧密接触条件下合成的，即被细胞所接受的抗原作为此细胞合成抗体的模板，所以抗体分子的最好折叠方式便与抗原在结构上互补。因此，抗体的特异性是由外部信息或指令决定的。其后，又提出抗体多肽链的两端可以折叠成无数的不同三维空间结构，这些结构方式可与抗原进行特异的互补，抗原——抗体结合的特异性是由抗原折叠方式决定的，而不是由氨基酸序列的差别决定的。
但是，不同的抗体分子确实有不同氨基酸序列，这些序列也的确与抗体的特异性有关，因此人们认为模板理论是错误的，便又提出了克隆选择学说。该学说认为产生抗体的淋巴细胞，即浆细胞前身细胞，含有合成可能受到攻击或尚未接触过的抗原的全部抗体的信息，一种抗原仅选择刺激能合成其相应抗体的淋巴细胞。凡是接受一种抗原的刺激并能合成与该抗原相应的特异抗体的所有淋巴细胞，即含有合成那种抗体所需要的遗传信息的一个淋巴细胞的直系子带统属于一个克隆；而机体内则有许多不同种类的淋巴细胞，并且一种淋巴细胞在接受一种抗原刺激后，只能合成一种或很少几种特异抗体，所以是多克隆的。一般认为，淋巴细胞膜上有抗原的受体，每一种克隆的淋巴细胞的受体只能与一种或极少几种抗原相嵌合，并且控制抗体产生的基因与基因之间在活性上有相互排斥作用(即淋巴细胞中一个特别基因有活性时，可排除所有其他基因的活性)；因此，抗原可识别合成特异抗体的淋巴细胞，使之只产生一种或很少几种特异抗体。
