指在脱氧核糖核酸(DNA)的双螺旋结构中，腺嘌呤(A)与胸腺嘧啶(T)配对，鸟嘌呤(G)与胞嘧啶(C)配对的规律。
是瓦特森——克里克(Watson-Crick)结构的核心。在恰尔卡夫(Chargaff，F．)当量规律、富兰克林(Franklin，R．)x射线晶体学成就的基础上，由瓦特森和克里克于1953年创立。两人根据富兰克林的照片得出结论：(1)DNA具有螺旋结构。(2)螺旋直径约20，螺距为34。
还根据DNA分子密度，指出DNA含两条核苷酸链，一条核苷酸链上的A必然与另一条核苷酸链上的T相对应，两条链上的G与C间也存在同样的对应互补关系。因为，只有这样嘌呤碱和嘧啶碱间才能既形成氢键，又保持双螺旋的恒定直径。
碱基配对律不仅为当量规律提供了科学解释，还对阐明DNA复制机制、DNA的多样性、稳定性、可变性奠定了科学基础。
