光镜的光源来自太阳光，而电镜的光源来自电子光束。且二者的放大倍数也有区别，电镜比光镜倍数更大，能看到的东西更加细致，电镜和光镜相比互有优劣。
在光学仪器里面，最常见的就是显微镜，显微镜又分为光镜和电镜。在光源上，光镜是借用凸透镜反射太阳光做光源，而电镜则是利用电子光束照射成像。
在放大倍数上，光镜最大也就只能放大到2000倍，而电镜则能放大到数十万倍。光镜只能看到生物表面的细胞，而电镜可以看到最深层的晶体结构。
虽然光镜看起来比不上电镜，但是光镜因为借用的自然光，所以对于观察的样品损伤更小。而且电镜只能看到黑白的影像，无法像光镜一样对样品进行染色。
